Исследования Аннеты Шапер затрагивают технические аспекты контроля над ядерными вооружениями, включая запрещение испытаний ядерного оружия, контроль над ядерным разоружением, размещение ядерного топлива и вопросы нераспространения, возникающие из военных и гражданских подходов к науке и технологиям. Она была временным членом немецкой делегации в Женеве по вопросам гражданской обороны, участвовала в переговорах по всестороннему соглашению о контроле над ядерным разоружением и также являлась членом немецкой делегации по пересмотру и продлении договора о ядерном нераспространении. Шапер получила кандидатскую степень по физике в университете Дюсельдорфа.